Hallo Wari also erstmal schönes Modell.

Zweitesn du hast keine richtigen Fehler gemacht, An der einen stelle ist es so schwarz weil sie überstehenden Kanten einen Schatten werfen mit gut positionierten Licht hast du dieses Problem allerdings nicht.
Das mit der komisch positionierten Kante liegt (glaube ich)auch am Licht und dass Licht sieht an dieser Stelle halt aus wie eine Kante da während man Modellt das Licht nur sehr schnell berechnet wird.
Dein letztes Beispiel sieht so seltsam aus weil die beiden Objekte sich überkreuzen das sieht man aber nach dem Rendering nicht mehr.
Einzelnde Flächen kann man übrigen mit Bridge verbinden.